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广西热作所现拥有国家非粮生物质能源工程技术研究中心木薯规模栽培技术研究室、国家非粮生物质能源工程技术研究中心木薯良种选育技术研究室、国家木薯产业技术体系栽培与植保研究室、国家木薯产业技术体系梧州综合试验站、国家麻类产业技术体系南宁剑麻综合试验站、国家科技部木薯国际科技合作基地、国家外专局木薯引进与利用示范推广基地、中国热带农业科学院广西亚热带作物科技研究中心、广西千亿元糖业研发中心、广西木薯良种培育育中心、广西芒果良种培育中心、广西澳洲坚果良种培育育中心等一批高起点的科研设施和平台。